在会计核算的各种方法中，设置会计科目占有重要的位置，它决定着账户的开设和报表结构的设计，是填制会计凭证和登记账簿的依据。会计科目的设置应当符合会计核算的一般原则及会计核算工作的基本要求，从而保证会计信息的质量，设置时应遵循下列原则：
科目设置原则
会计科目作为对会计要素具体内容进行分类核算，科目的设置应能保证对各会计要素做全面地反映，形成一个完整的体系。
合法性原则，是指所设置的会计科目应当符合统一的会计制度的规定。中国现行的统一会计制度中均对企业设置的会计科目作出规定，以保证不同企业对外提供的会计信息的可比性。企业应当参照会计制度中的统一规定的会计科目，根据自身的实际情况设置会计科目，但其设置的会计科目不得违反现行会计制度的规定，对于统一会计制度规定的会计科目。企业可以根据自身的生产经营特点，在不影响统一会计核算要求以及对外提供统一的财务报表的前提下，自行增设、减少或合并某些会计科目。
相关性原则，是指所设置的会计科目应当为提供有关各方所需要的会计信息服务，满足对外报告与对内管理的要求。根据企业会计准则的规定，企业财务报告提供的信息必须满足对内对外各方面的需要，而设置会计科目必须服务于会计信息的提供，必须与财务报告的编制相协调，相关联。
会计科目作为对会计要素分类核算的项目，要求简单明确，字义相符，通俗易懂。同时，企业对每个会计科目所反映的经济内容也必须做到界限明确，既要避免不同会计科目所反映的内容重叠的现象，也要防止全部会计科目未能涵盖企业某些经济内容的现象。
在合法性的基础上，企业应当根据组织形式、所处行业、经营内容、业务种类等自身特点，设置符合企业需要的会计科目。会计科目设置应该简单明了通俗易懂。突出重点，对不重要的信息进行合并或删减。要尽量使读者一目了然，便于理解。
会计科目和会计要素的关系
会计科目和会计要素的关系在于，会计科目是对会计要素进行分类，所以会计科目的设置必须结合会计要素的特点。为了连续、系统、全面地记录和反映企业经济业务，为信息使用者提供更全面有效的信息，要对会计要素内容的再分类，科学合理确定的会计科目。会计要素是组成企业经济业务内容的重要部分，指的是对会计对象所作的基本分类。同时会计要素也是会计编写会计分录、编制记账凭证的合理依据。
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如果没有会计要素，会计核算和监督将犹如一盘散沙般杂乱无序。而会计科目又是对会计要素具体内容的一个表述，它使得会计要素更加细化了。会计要素在会计上可以分为资产、负债、所有者权益、收入、费用、利润六大类；而会计科目按照经济业务的内容也可以分为资产类、负债类、所有者权益类、损益类、成本类。
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